Иностранный отдел «Аусланд». На него возлагались задачи по изучению состояния экономики, внешней и внутренней политики иностранных государств на основе сведений, поступающих от военных атташатов и других официальных учреждений за границей (руководитель — адмирал Л. Брюкнер).
Центральный отдел. В его функции входило комплектование кадрами, обеспечение материальными и финансовыми средствами, разработка мобпланов на военное время (руководитель — генерал-майор Г. Остер).
Практическую разведывательную, контрразведывательную и диверсионную деятельность осуществляли низовые органы абвера — абверштелле, существовавшие при каждом военном округе.
15 октября 1939 г. при «Абвер-2» была создана рота специального назначения, получившая кодовое название: «Строительная учебная рота для специальных применений 800», место дислокации — г. Бранденбург. Чем занимались эти «строители», вскоре познали в Чехословакии, Польше, Дании, Бельгии и Франции. В состав роты вошли сто лучших боевиков из расформированного спецподразделения «Эббингауз».
Один из первых руководителей роты — обер-лейтенант Хиппель — так определил задачи своих подчиненных:
Вскоре рота была преобразована в батальон, который 12 октября 1940 г. стал базой для формирования полка «Бранденбург-800». В ноябре 1942 г. полк развернули до штата дивизии в составе пяти полков. Укомплектованное отборными головорезами, это военное формирование предназначалось для осуществления диверсионно-террористических акций, ведения разведки и выполнения специальных заданий высшего командования в тылу противника.
Осенью 1941 г. отдел «Абвер-2» создал еще одно спецподразделение — батальон «Бергман» («Горец»). Его костяк составляли выходцы с Северного Кавказа, и предназначался он для проведения диверсий, терактов и организации повстанческого движения в этом регионе.
Позднее, весной 1943 г., на базе одного из полков дивизии «Бранденбург 800» — 805-го полка — было образовано новое подразделение — учебный полк «Курфюрст». Он стал основным учебным центром по подготовке диверсантов и террористов абвера.
Наряду с абвером для проведения разведывательной и диверсионно-террористической деятельности против СССР в марте 1942 г. в составе Главного управления имперской безопасности Германии (РСХА) было сформировано новое специальное подразделение — «Унтернемен Цеппелин» (предприятие «Цеппелин»).
На дальневосточных рубежах отечественным спецслужбам противостояла многоопытная японская разведка. Координатором в проведении разведывательно-подрывной работы против СССР выступал 5-й (русский) отдел 2-го разведывательного управления Генерального штаба Японии и его структурные подразделения в воинских частях вплоть до полка. В этих же целях японская разведка широко использовала возможности различных министерств, ведомств, торговых представительств на территории СССР, а также многочисленные русские эмигрантские организации: «Российский фашистский союз», «Главное бюро эмиграции в Маньчжурии» и т. д., действовавшие на территории Китая и Маньчжурии.