В итоге в Гражданскую войну казачья альтернатива оказалась несостоятельной. Большинство казачьих атаманов этого периода — главных выразителей настроений казачьей массы — были фигурами малопривлекательными. Малопривлекательной была и позиция самого казачества. Не случайно многие мемуаристы отмечали, что в условиях ослабления контроля центра казаки превращались в деструктивную массу. В данном случае вполне уместно провести параллель с действиями казачества в Смуту XVII в.
Свою негативную роль сыграло и некоторое недоверие к казакам со стороны белого командования, которое так и не решилось сделать ставку на казачество и поддержать его необходимыми пополнениями и техникой в самый напряжённый период борьбы. Казаки востока России (в первую очередь Уральского и Оренбургского казачьих войск, на долю которых и выпала здесь основная тяжесть вооружённой борьбы с красными) оказались фактически брошены и предоставлены самим себе. После незапланированного, как утверждают некоторые мемуаристы, отхода на Оренбург 2-й Сызранской стрелковой дивизии полковника А.С. Бакича при отступлении белых с Волги в октябре 1918 г. ни Юго-Западная, ни её преемница Отдельная Оренбургская армии до мая 1919 г. не получили в своё распоряжение ни одной воинской части (пожалуй, кроме 42-го Троицкого стрелкового полка). Более того, из армии был изъят целый армейский корпус (того же А.С. Бакича), кадровая бригада, казачий полк и авиационный отряд. Всё это формировало в казачестве чувство одиночества в борьбе с превосходящим противником. Присутствие даже незначительных контингентов союзников или небольших частей других казачьих войск могло бы полностью изменить ситуацию, дав понять казакам, что они не одиноки в своей борьбе. К тому же при умелом использовании (в качестве армейской конницы, а не территориальных частей) казаки могли дать прекрасный боевой материал (и давали его[2473], но в меньшем количестве, чем могли бы).
Для оренбургских казаков Гражданская война была необычной и очень тяжёлой. Они не были к ней подготовлены. Всё было в новинку. Впервые казаки сражались как самостоятельная сила, создали свою армию, активно использовали пластунские части, впервые в войске появились казачий авиаотряд и собственная бронетехника. К бремени власти не были готовы ни Войсковое правительство, ни сам атаман Дутов (несмотря на его политический багаж 1917 г.), а ведь оно, как один из очагов сопротивления большевикам, до создания единой всероссийской власти осенью 1918 г. имело самостоятельное общегосударственное значение, и ответственность на плечи Дутова ложилась колоссальная.
Гражданская война обострила давние противоречия между казаками и крестьянами, казаками и их степными соседями. Оренбургские казаки (как и их соседи уральцы) были вынуждены сражаться на огромной территории практически отдельно от своих союзников по борьбе, не получая не только усиления пехотными частями (большинство казачьих частей были конными), но часто и необходимых запасов — по некоторым данным, Отдельная Оренбургская армия снабжалась Ставкой по остаточному принципу — после Сибирской и Западной армий. Несмотря на изначально неблагоприятные условия, в Оренбургском казачьем войске отсутствовали такие негативные для Белого движения явления, порождённые революцией и Гражданской войной, как казачий сепаратизм и «атаманщина». Атаман Дутов был политической фигурой общероссийского масштаба и не представлял себе казачество вне борьбы с большевиками и вне России. Как писал Генерального штаба генерал-майор И.Г. Акулинин,
Нельзя согласиться с тезисом о том, что казачество, в том числе оренбургское, не пошло в армии Дутова и Колчака. По мнению Е.В. Волкова и Л.И. Футорянского, оренбургское казачество потенциально могло выставить против красных до 70.000 бойцов от 18 до 48 лет, однако на практике выставило в несколько раз меньше — не более 35.000 человек, или 6% населения войска[2475]. При этом Л.И. Футорянский пишет, что в Первую мировую войну Оренбургское казачье войско выставило 31,6 тысячи бойцов[2476].